2008/2009 nådde lodjursstammen i Sverige en toppnotering med 291 familjegrupper. Inventeringen 2013/2014 visade på 142 familjegrupper, alltså en minskning med över 50 procent.
Enligt Naturvårdsverkets beräkningar baserade på den senaste inventeringen finns det totalt 840 lodjur i landet vilket är strax under referensvärdet på 870 individer. Referensvärdet anger den nivå som inte bör understigas för att uppnå gynnsam bevarandestatus. För att klara det målet måste nedgången av lodjursstammen nu bromsas upp, konstaterar Naturvårdsverket.
Naturvårdsverket har inget entydigt svar på orsaken till nedgången. Inom renskötselområdet beror det på ökad jakt, i Mellansverige kan orsaken vara minskad tillgång på bytesdjur eller konkurrens med andra rovdjur. En annan förklaring kan vara svårigheter i inventeringsarbetet och att de tidigare inventeringsmetoderna överskattade lodjursstammens storlek.
Sedan i fjol samkörs beståndsövervakningen med Norge och det visar bland annat att 70 procent av den skandinaviska lodjursstammen finns i Sverige.