Under tio år har Kemi kritiserats för att det tagit lång tid att få bekämpningsmedel godkända. Enligt Justitiekanslern, JK, beror det på "strukturella brister under lång tid" hos myndigheten. JK anser också att det är anmärkningsvärt att de ansträngningar Kemi under en följd av år gjort för att snabba på hanteringen inte har gett tydliga resultat.
Enligt JK har "systematiska defekter" gjort Kemis effektiviseringsarbete kontraproduktivt. Därför krävs omedelbara insatser för att öka tempot hos Kemi, anser JK.
JK har fått flera anmälningar mot Kemi. Branschföreningarna Svenskt Växtskydd och Dansk Plantevaern, LRF samt ett antal växtskyddsföretag har alla anmält myndigheten till JK.
Numera ska biocider, rengörings- och saneringsmedel, också godkännas av myndigheten. Men Kemis handlingsoförmåga har enligt anmälaren Swiss Inno Solutions AG lett till att Sverige:
Den så kallade miljömyndighetsutredningen fann tidigare i vår att det behövs en ny miljöinspektion som tar över Kemis verksamhet. Skälen var "allvarliga brister i effektivitet, enhetlighet, rättssäkerhet samt konkurrensneutralitet i tillståndsgivning och tillsyn".